構造的に間取りの制限はありますか?

制限はあります。
木造軸組工法の場合、柱と柱の間隔（=スパン）は、構造的に広げられる最大スパンが定められています。それらの事を考えながら、お客様の要望にお応えするように設計することを心がけていますので、ご相談される場合は、遠慮なさらずにご希望を担当者にお伝えください。